特別深い理由はないのだけれど、自宅では2台のPCでATOKを使っている。環境の同期を、バックアップツールできちんとやってみるのと合わせ、古いバージョンのATOKのデータが残っているような感じでもあるサブPCのほう、一旦ATOKをアンインストールしてから再度インストール。
しかし、やはりレジストリにはアンインストールしても設定が残るらしく、コンパネからアンインストールしてもそういうデータは残っていて、再インストールしたら勝手に設定が復帰した。
定額制の契約情報が残って消えないというのは仕方が無いと思うが、アンインストールしたらそういうデータも消えないとおかしい。
その後、バックアップツールでの復元は問題なく完了している。